翼状胬肉cDNA文库的构建及序列分析
近日,攀枝花学院附属医院眼科研究人员发表论文,旨在研究翼状胬肉形成的机制及其形成的相关基因。研究指出,在国内首次构建了翼状胬肉的cDNA文库,为研究翼状胬肉的发病机理提供了新思路。该文发表在《基础医学与临床》2013年第33卷第12期上。
利用SMART技术构建翼状胬肉组织的cDNA文库,随机挑取800个克隆进行测序和分析。
该文库的库容量为1.2×106,重组率为94%,平均插入片段大小为1 kb左右。经Phrap软件聚类拼接后得到663条单基因簇,包括549个单拷贝和114个重叠群。使用BLAST软件进行同源性分析,发现85条序列(12.82%)没有功能注解;578条序列(87.18%)有功能注解。将所得的578条序列(ESTs)按照人组织基因表达谱分类标准进行分类,其中与转录和翻译相关基因的EST最多,占到41%。同时还发现了一些可能参与翼状胬肉形成的相关基因。
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