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应用MALDI-TOF-MS分析大肠癌血浆相关蛋白差异表达

  近日,武汉大学人民医院消化科研究人员发表论文,旨在通过对大肠癌患者血浆蛋白质组学表达差异的研究,以期寻找大肠癌早期诊断及新相关特异的性标志物。研究指出,运用MALDI-TOF-MS技术分析大肠癌血浆蛋白质差异表达对大肠癌早期诊断以及发现或寻找新的肿瘤标志物可能具有一定的临床价值。该文发表在2012年第15期《中国现代医学杂志》上。

  采用弱阳离子(MB-WCX)磁珠结合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MAL-DI-TOF-MS)技术检测样品血浆蛋白质质谱,运用Ciphergen ProteinChip Software 3.2.1软件及BiomarkWizard 5.0软件进行数据分析筛选,并对差异表达显著的质谱峰于Swiss-Prot及TrEMBL蛋白数据库进行检索。

  通过对比研究大肠癌组、大肠腺瘤组及正常对照组血浆差异表达质谱峰,共发现23个差异表达蛋白质谱峰,其中在大肠癌组中4个显著差异高表达(P<0.05),荷质比(M/Z)分别为6 683、8 700、9 187、9 342;虽在大肠腺瘤组与正常组蛋白质谱峰表达无显著性差异(P>0.05),但三组间荷质比为6 683、8 700蛋白表达呈一定递进性趋势;检索Swiss-Prot蛋白质数据库结果:M/Z 6 683是成纤维细胞生长因子受体-1(FGFR1),其余均为未知蛋白,有待进一步鉴定。本研究通过表达差异蛋白建立诊断模型对大肠癌预测的准确率、敏感性、特异性分别为89.19%、83.33%、84%。