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大肠癌综合性分子特性被揭示

  7月18日,Nature杂志以开放文章的形式在线报道,众多科学家联手对结直肠癌的分子特点进行了一次综合深入的研究,获得了大量的有用信息。

  为研究大肠癌的体细胞改变,研究者对276个肿瘤样本的外显子组序列,DNA拷贝数,启动子甲基化状态和信使RNA和microRNA表达进行了基因组规模的分析。

  这些样本中的一部分(97例)低深度覆盖全基因组测序。结果发现,16%的大肠癌存在高度的突变:这些样本的四分之三具有预料中的高度微卫星DNA不稳定,通常伴有高甲基化和MLH1的沉默,四分之一具有体细胞错配修复基因和聚合酶ε(POLE)的突变。

  剔除含有高度基因突变的那部分肿瘤病例,科学家发现结肠癌和直肠癌基因组的改变有相当类似的模式。二十四个基因显著突变,除了预期的APC,TP53,Smad4、PIK3CA和KRAS突变,研究者还发现,ARID1A,SOX9和FAM123B频繁的突变。

  发生经常拷贝数改变的基因包括,潜在的药物靶点ErbB2的扩增和新发现的IGF2基因的扩增。经常发生的染色体易位包括,NAV2的Wnt信号通路成员TCF7L1融合。

  总之,本研究发现了一些新的侵袭性的大肠癌的标志物,以及MYC指导的转录激活和抑制在结直肠癌中的重要作用。

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