变应性鼻炎患者外周血基因芯片检测及差异表达基因研究
近日,复旦大学附属眼耳鼻喉科医院耳鼻喉科研究人员发表论文,旨在利用基因芯片研究变应性鼻炎(AR)基因表达谱的改变,从基因水平深入探讨AR的发病机制。研究指出,AR存在多基因表达调控的异常;对其功能及信号通路进行分析,有助于从基因网络揭示AR的病理生理机制;IL-33在AR发生、发展过程中发挥重要作用,对其深入研究有可能为AR的临床治疗提供新的方向与靶点。该文发表在2014年第02期《中国眼耳鼻喉科杂志》上。
应用GeneChip Human Gene 1.0 ST Array检测4例常年性AR与4例非AR患者外周血单个核细胞的基因表达谱,分析差异表达基因及其功能、信号通路,并选择有显著差异表达的部分基因进行实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证。
基因芯片筛选出差异表达基因2 347条,其功能主要与免疫应答、炎症反应、免疫调控、基因转录、细胞代谢、抗体生成、细胞增殖、信号转导、多种酶活性、膜受体结合活性、细胞结构蛋白活性等有关;对差异基因进行功能与信号通路分析,证实细胞因子-细胞因子受体、JAK-STAT通路、SOCS系统,在AR发生、发展过程中的相互作用和复杂变化。qRT-PCR测定差异表达基因IL-4R、SOCS、IL-33和TNFRSF的表达水平,与芯片试验结果一致。
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