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基于表达谱分析识别鼻咽癌血管生成及淋巴管生成的调控通路

  近日,南方医科大学第一临床医学院研究人员发表论文,旨在探讨鼻咽癌是通过调节哪些靶基因的表达影响血管生成和淋巴管生成。研究指出,PTGS2和NFκB共同调控鼻咽癌血管生成,Toll样受体信号通路可能与淋巴管生成密切相关。它们的相互作用方式值得进一步研究。该文发表在2012年第11期《南方医科大学学报》杂志上。

  以Sengupta等通过基因芯片数据(其中含10例正常鼻咽组织,31例鼻咽癌组织)分析所得的831个鼻咽癌与正常鼻咽组织差异表达基因为基础,根据最新的基因组信息以及设定差异表达值的最小阈值260,筛选出246个有效基因。对这246个基因进行基于文献挖掘的基因功能分析和网络构建,最后进行通路分析。

  246个基因与鼻咽癌、EB病毒、转移、血管生成、淋巴管生成、侵袭等关键词特异相关。其中,52个基因已知与血管生成相关(P=0.00001),19个基因构成了血管生成基因网络(P=0.0042);21个基因已知与淋巴管生成相关(P=0.00001),6个基因构成了与淋巴管生成相关基因网络(P=0.0226)。包含PTGS2在内的8个基因参与NFκB信号通路已知在小细胞肺癌中与血管生成密切相关(P=7.87E-07)。包含STAT1及CXCL10等在内的5个基因参与了Toll样受体通路(P=0.00176)。