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SLC26A4基因编码区功能特征及分子进化分析

  近日,南京医科大学第一临床医学院研究人员发表论文,旨在探讨溶质转运家族26,成员4(SLC26A4)基因编码区的功能特征及其突变与遗传性非综合征型耳聋(NSHL)发生的关联性。研究指出,SLC26A4基因突变在NSHL发生中发挥重要作用,发生在保守区的错义突变将导致蛋白结构和功能的改变,从而产生相应的表型。C末端的STAS结构域内的插入序列可能在人类中有独特的作用。该文发表在2013年第11期《 南京医科大学学报(自然科学版)》杂志上。

  应用生物信息学方法对37个物种的SLC26A4基因编码蛋白(Pendrin)的序列进行系统发育分析,并用滑窗法进一步预测保守区,同时利用在线软件对其编码产物进行结构预测和同源建模。

  SLC26A4基因在哺乳动物中尤其是灵长目动物中高度保守,通过滑窗法预测得到了12个保守区。二维结构预测提示Pendrin的N末端和C末端可能存在卷曲螺旋结构,同源建模预测显示STAS结构域中的插入序列(IVS)存在物种间差异性。